Anthropic’in araştırma amaçlı Claude sürümü, 64 saatte 318.484 protein adayı tasarladı. Laboratuvarda incelenen 211 tasarım arasından akrep toksinlerine bağlandığı belirlenen 17 aday çıktı. Ancak sonuçlar, bu proteinlerin zehri etkisizleştirdiğini ya da insanlarda kullanılabilecek bir panzehir olduğunu göstermiyor.
Araştırma sürümü araçlarla çalıştı
Çalışmada, herkesin erişebildiği standart sohbet oturumundan farklı, yayımlanmamış bir Claude sürümü kullanıldı. Model, Claude Science ortamında protein tasarımı ve değerlendirmeye yönelik araçlardan yararlandı. Bu nedenle bulgular, aynı isteği sıradan bir sohbet kutusuna yazarak elde edilebilecek hazır bir ürün özelliği olarak değerlendirilmemeli.
Araştırmacılar Meksika, Brezilya, Kuzey Afrika ve Orta Doğu’daki akrep türleriyle ilişkili beş nörotoksini hedef aldı. Modelin oluşturduğu çok sayıdaki aday arasından daha küçük bir grup laboratuvar testine alındı. Bilgisayar ortamında başarılı görünen tasarımların hepsi deneylerde aynı sonucu vermedi.
211 tasarımın sonuçları paylaşıldı
Anthropic’in yayımladığı açık veri paketi, değerlendirilen 211 tasarımın sonuçlarını ayrı ayrı içeriyor. Adaptyv Bio ve Twist Bioscience, proteinlerin toksinlere bağlanmasını yüzey plazmon rezonansı yöntemiyle ölçtü. Kayıtlarda başarılı adayların yanı sıra bağlanma göstermeyen ve sonucu belirsiz kalan tasarımlar da yer alıyor.
Veri paketine göre 17 bağlayıcının yedisi Cn2, dördü AaH II, dördü AaH I ve ikisi LqhIII toksinine yönelik. Ts1 için aynı ölçütleri karşılayan bir bağlayıcı bulunmadı. LqhIII ölçümleri ise yalnızca Adaptyv Bio tarafından yapıldı; bu nedenle bütün başarılı adayların iki laboratuvarda aynı deneyle doğrulandığı söylenemez.
Toksine bağlanma, etkisizleştirme kanıtı değil
Bir proteinin toksine tutunması, toksinin sinir hücreleri üzerindeki etkisini durdurduğunu tek başına kanıtlamıyor. Veri açıklamasında, Cn2-B1 için beklenen nötralizasyonun hücrelerde elektriksel kayıt yöntemiyle henüz test edilmediği özellikle belirtiliyor. Dolayısıyla çalışma, tedavi başarısından önceki bir araştırma aşamasını gösteriyor.
Deneyler laboratuvarda hazırlanmış belirli toksinlerle yürütüldü. Gerçek akrep zehrinin tüm bileşenleri, canlı organizmadaki etkiler, güvenlik ve kalıcılık bu çalışmada incelenmedi. Bu yüzden elde edilen bağlanma sonuçları, hastanede kullanılabilecek bir ürünün etkinliğini veya güvenliğini ortaya koymuyor.
Araştırmacılar protein tasarımlarını, ölçüm kayıtlarını ve tahmini yapıları CC BY 4.0 lisansıyla erişime açtı. Verilerin paylaşılması, başka ekiplerin sonuçları inceleyebilmesine ve yeni deneyler planlamasına olanak tanıyor. Adayların toksine bağlanmasının yanı sıra biyolojik etkisini gerçekten engelleyip engellemediğinin ölçülmesi gerekiyor.
